Chmura obliczeniowa w służbie genetyki

Analiza łańcuchów RNA, bardzo istotna w dzisiejszej medycynie, wymaga ogromnych mocy obliczeniowych. Dzięki chmurze obliczeniowej udało się znacznie obniżyć koszty, a wyniki dostępne są praktycznie na bieżąco.

Naukowcy codziennie dostarczają miliardy łańcuchów do analiz, co czyni ten proces niezwykle kosztownym i czasochłonnym. Z pomocą przyszła technologia obliczeń w chmurze i projekt "Myrna" - oprogramowanie opracowane przez badaczy z ośrodka Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health.

Obecnie wiele firm, takich jak Microsoft czy Amazon, udostępnia odpowiednie centra obliczeniowe. Z ich punktu widzenia zarządzanie ogromną siecią komputerów jest tanie i efektywne, a uwalnia instytuty badawcze od potrzeby utrzymywania własnych superkomputerów.

Analiza 1,1 miliarda próbek RNA trwała dwie godziny, a jej koszt wyniósł zalewie 66 dolarów. "W wielu eksperymentach biologicznych dane są generowane tak szybko, że potrzeba znacznej liczby jednocześnie pracujących komputerów, aby przeprowadzić analizy statystyczne" - tłumaczy Leek, biostatystyk - "Dzięki nowemu podejściu w projekcie "Myrna", możemy błyskawicznie opracowac rezultaty i dopasować profile genetyczne do rozmaitych chorób. Choć badania ograniczają się do tego konkretnego obszaru, idea przetwarzania w chmurze modeli statystycznych może być użyteczna także w innych eksperymentach, które generują znaczną liczbę danych".

Zespół badawczy, poza funduszami uczelni, otrzymał darmowe wsparcie portalu Amazon.
 

Źródło: Science Daily

Polecamy artykuły:
GeForce GTX 480 vs Radeon 5970 – pojedynek!	Eee Keyboard PC - komputer w klawiaturze	GamesCom 2010: najciekawsze nowości i gry